UTokyo的本科教育有10个主要的学术部门:农业,艺术和科学,经济,教育,工程,法律,文学,医学,药学科学和科学。本科生在前两年学习文科课程,后两年专攻文科。在该大学的15个研究生院中,有10个与相应的本科院系密切相关。其他五个研究生院侧重于前沿科学、信息科学和技术、跨学科信息研究、数学科学和公共政策。这所大学的校历有四个学期。教学的主要语言是日语,但是一些本科课程甚至更多的研究生课程是用英语教学的。英语授课的研究生课程包括经济学的国际课程以及建筑和城市设计的课程。UTokyo的研究中心和附属机构包括大气和海洋研究所、亚洲高级研究所和空间信息科学中心。